Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CA13Q8N1Q1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CA13Q8N1Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CA13Q8N1Q1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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