Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC8AQ8IWT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8AQ8IWT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms