Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGDCC3Q8IVU1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGDCC3Q8IVU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms