Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC50Q8IVM0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC50Q8IVM0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms