Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSIG1Q86XK7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms