Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP1Q86W92 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms