Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPM2Q86SE8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms