Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP50Q70EL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP50Q70EL3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms