Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM43Q6ZSC3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.3 ms