Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMBQ6PCB8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms