Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LETMD1Q6P1Q0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms