Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TNS3Q68CZ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNS3Q68CZ2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms