Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRAGBQ5VZM2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms