Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHEQ5VZ18 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms