Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ECM29Q5VYK3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM29Q5VYK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms