Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SUSD4Q5VX71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUSD4Q5VX71 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms