Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GARNL3Q5VVW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms