Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF20Q5VTR2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms