Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf220Q5T0J3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms