Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms