Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP188Q5SRE5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms