Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms