Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms