Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF542PQ5EBM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF542PQ5EBM4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms