Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL39P5Q59GN2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms