Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRDTQ58F21 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRDTQ58F21 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms