Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKDCCQ504Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms