Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA3BQ502W6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms