Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GREB1Q4ZG55 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GREB1Q4ZG55 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms