Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LONRF3Q496Y0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF3Q496Y0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms