Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNF212Q495C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms