Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TWISTNBQ3B726 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms