Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIDA1Q1XH10 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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