Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP1Q15431 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP1Q15431 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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