Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDCD1Q15116 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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