Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL1Q13616 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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