Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NAE1Q13564 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms