Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PKD2Q13563 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKD2Q13563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKD2Q13563 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
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