Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TMED1Q13445 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TMED1Q13445 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMED1Q13445 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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