Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SF3B2Q13435 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SF3B2Q13435 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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