Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3BQ13214 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms