Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC16Q13042 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC16Q13042 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC16Q13042 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC16Q13042 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC16Q13042 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms