Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPQ12770 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPQ12770 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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