Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 MIP6YHR015W 1980 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDR149CYDR149C 708 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 FRQ1YDR373W 573 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SPT3YDR392W 1014 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YER034WYER034W 558 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DDI2YFL061W 678 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 KXD1YGL079W 657 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DLS1YJL065C 504 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DDI3YNL335W 678 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SUR1YPL057C 1149 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SKN7YHR206W 1869 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 CPA2YJR109C 3357 nt3.64□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 URA2YJL130C 6645 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 TCP1YDR212W 1680 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 GIS4YML006C 2325 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RPS29BYDL061C 171 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDL228CYDL228C 642 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ATP12YJL180C 978 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 COS1YNL336W 1146 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 HUB1YNR032C-A 222 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PEX11YOL147C 711 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YPR077CYPR077C 372 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DOA4YDR069C 2781 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RSC1YGR056W 2787 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 CCM1YGR150C 2595 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ARG2YJL071W 1725 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ATP25YMR098C 1839 nt3.63□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RCY1YJL204C 2523 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDL162CYDL162C 357 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDR230WYDR230W 348 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 MAG1YER142C 891 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ADH4YGL256W 1149 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 REC104YHR157W 549 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ANB1YJR047C 474 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PCD1YLR151C 1023 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RTT109YLL002W 1311 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ECM18YDR125C 1362 nt3.62□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ROM1YGR070W 3468 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PHO81YGR233C 3537 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDL199CYDL199C 2064 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 EBS1YDR206W 2655 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ATG26YLR189C 3597 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ASI1YMR119W 1875 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RDI1YDL135C 609 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YGL074CYGL074C 327 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SOL3YHR163W 750 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 HIS5YIL116W 1158 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 MRPL3YMR024W 1173 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 INN1YNL152W 1230 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DGA1YOR245C 1257 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 PEP4YPL154C 1218 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SET1YHR119W 3243 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 ERG9YHR190W 1335 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SPO71YDR104C 3738 nt3.61□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SMC3YJL074C 3693 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 LOS1YKL205W 3303 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 FAR8YMR029C 1572 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YCR015CYCR015C 954 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SEC53YFL045C 765 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YLR416CYLR416C 399 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 MDJ2YNL328C 441 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 VAM10YOR068C 345 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YOR082CYOR082C 342 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YPR078CYPR078C 1119 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 VIP1YLR410W 3441 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 DBP5YOR046C 1449 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 FAT1YBR041W 2010 nt3.6□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YDL180WYDL180W 1644 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 AIP1YMR092C 1848 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RPL35BYDL136W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 CLB3YDL155W 1284 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RMD5YDR255C 1266 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 SPT2YER161C 1002 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 KEG1YFR042W 603 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 RSM26YJR101W 801 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YLR311CYLR311C 348 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YNL057WYNL057W 333 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YBR225WYBR225W 2703 nt3.59□□□□□ -1.83
NFI1Q12216 YMR317WYMR317W 3423 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YGR237CYGR237C 2358 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 FAD1YDL045C 921 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 TMA17YDL110C 453 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 AIM6YDL237W 1173 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 TGL2YDR058C 981 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 LST7YGR057C 729 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RPS4BYHR203C 786 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 MAK16YAL025C 921 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YJR111CYJR111C 852 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 GAT3YLR013W 426 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YNL035CYNL035C 1170 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YBL065WYBL065W 345 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 RAS1YOR101W 930 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 PLM2YDR501W 1566 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 HRD1YOL013C 1656 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 FAR1YJL157C 2493 nt3.58□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 HOM2YDR158W 1098 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 YPS7YDR349C 1791 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 CGR1YGL029W 363 nt3.57□□□□□ -1.84
NFI1Q12216 CFD1YIL003W 882 nt3.57□□□□□ -1.84
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