Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPAL4Q0D2K0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms