Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP4F3Q08477 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms