Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LRP1Q07954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms