Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL16A1Q07092 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms