Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SRSF11Q05519 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF11Q05519 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms