Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNEQ04844 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms